微生物組、代謝組和轉(zhuǎn)錄組揭示宮頸微生物群與宿主基因調(diào)控關(guān)系
Time:
Sep 21,2023
研究背景
接受剖宮產(chǎn)手術(shù)的女性可能會患上剖宮產(chǎn)瘢痕憩室 (CSD)。CSD是由于子宮局部切口愈合不良,形成與子宮腔相連的凹陷或空腔,可導(dǎo)致各種近期和遠(yuǎn)期并發(fā)癥,之前的研究表明,持續(xù)性積液是影響 CSD 女性生育能力的主要因素。
女性生殖道具有獨特的微生物組,在維持體內(nèi)平衡和某些疾病的發(fā)展中起著至關(guān)重要的作用。當(dāng)生態(tài)失調(diào)發(fā)生時,改變的免疫和代謝信號會產(chǎn)生相應(yīng)的反應(yīng),包括慢性炎癥、上皮屏障破壞、血管生成和代謝失調(diào)。之前的研究表明,CSD 持續(xù)性積液是由局部炎癥和免疫失衡引起的,而局部微生物干擾在這一過程中起著核心作用。然而,局部微生物群活動的特征和微生物與宿主相互作用的機制仍然未知。在本研究中,將非靶向代謝組學(xué)和人類宿主轉(zhuǎn)錄組相結(jié)合,分析了CSD微生物的活性特征以及微生物與宿主相互作用的機制。
研究結(jié)果
1、宮頸微生物群的多樣性和組成特征
研究共納入 52 名受試者,其中 CSD 組 28 名,CON 組 24 名。通過Shannon-Wiener指數(shù)計算的CSD組門(圖1A)和屬水平(圖1B )微生物群的α多樣性顯著高于CON組,表明CSD組的微生物組成顯著高于CON組。CSD組更豐富。基于 Bray-Curtis 的 PCoA 圖和 ANOSIM 分析顯示,CSD 組樣本之間的距離明顯大于 CON 組(圖 1C)。門水平的分類在兩組之間顯示出不同的模式,在CON組中厚壁菌門占絕大多數(shù)(圖1D)。在 CSD 組中,厚壁菌門的比例下降到 62%,變形菌門和放線菌門的比例分別增加到 20% 和 10%(圖 1E)。兩組在屬水平上的組成也呈現(xiàn)出顯著差異。
本研究剖析了兩組之間厚壁菌門和變形菌門的屬組成。在厚壁菌門下, CSD組(圖1F )的乳酸菌比例較CON組(圖1H)下降,而鏈球菌和腸球菌的比例增加, CSD 組(圖 1G)和 CON 組(圖 1I)之間存在不同程度的差異。這些結(jié)果表明,CSD組微生物群的多樣性和組成與CON組有顯著差異, CSD組乳酸桿菌的比例顯著降低。
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